生物医学智能云计算团队

屈小波 教授 国家优青 电子科学与技术学院

国家优青、福建杰青、厦门大学南强拔尖人才、厦门市重点引进人才;电子科学与技术学院电子科学系副主任、福建省等离子体与磁共振研究重点实验室副主任、中国移动(厦门)-电子学院生物医学智能云研发中心主任。研究方向:人工智能;机器学习;医学成像与图像分析;磁共振成像与波谱;医疗大数据与云计算;蛋白质结构分析。

董继扬 南教授

研究方向:机器学习、质谱成像分析、代谢网络建模与分析、健康大数据分析 。

林东海 教授

化学化工学院生物学系“闽江学者”特聘教授,研究方向:生物核磁共振,代谢组学,结构生物学

任克 教授

研究方向:影像医学与核医学。涉及磁共振功能成像及对比剂研究,腹部肿瘤影像诊断及介入治疗,糖尿病磁共振、CT影像研究等。

林建忠 主任医师

研究方向:医学影像,涉及常规磁共振诊断;拥有linux操作系统AFNI,SPM,FSL,freesurfer的脑功能及结构处理经验十几年。

研究内容

磁共振分子影像智能云研究

磁共振波谱成像是一种无创、定性、定量、定位的分子影像技术,可成像几十种生命活动代谢产物,但信号强度比常规磁共振成像信号低 3~4个量级,信噪比低,数据维度高。项目从磁共振分子影像出发,拟开展快速高分辨波谱成像及临床评估,挖掘磁共振物理和生命代谢产物信号特点,探索高维指数张量和人工智能超快速成像方法,建立开放式智能云端量化分析平台,应用于人工智能预测蛋白质结构预测、脑科学、肿瘤/癫痫等重大疾病的临床科研。团队主要成员由从事磁共振成像、机器学习、人工智能、代谢组学、临床医学专家共同组成,多方已经在行业内权威期刊联合发文多篇,近期一起进行癫痫、肿瘤等重大疾病的联合攻关。

研究成果

屈小波老师:共计主持1000多万研究经费,共计发表期刊论文80篇(近5年来以第一或通信(含共同通信)作者发表顶级期刊12篇,单篇论文影响因子最高12,IF大于10的6篇,特邀综述2篇,ESI高引论文8篇),Web of Science(WOS) 引用 1400+, Med. Image Anal. 2014 年发表论文是该刊(IF 11.1)当年所有论文至今 WOS 引用第一),授权中国发明专利 12 项。所提智能成像方法被行业高端医疗设备商产业化,应用于腹部快速成像和脑肿瘤量化成像,在哈佛医学院附属医院科研应用等。指导学生获国际华人磁共振协会青年研究员奖、第十六届研电赛全国决赛商业计划书全国一等奖、数字中国创新大赛智慧医疗二等奖等。董继扬老师:主持国家自然科学基金、福建省自然科学基金等10余个项目,在包括Nat. Comm, Anal. Chem., J. Proteomics Res., J Biophotonics, Food Res. Int., Metabolomics, The Innovation等国内外重要学术期刊上发表研究论文102篇,其中SCI收录论文67篇,这些论文已被引用800多次。获得授权的国家发明专利3项,自主开发核磁共振数据分析软件、代谢组学数据分析软件、质谱成像数据分析软件等,并获软件著作权8个。林东海老师:在Nature Chemical Biology, Nature Communication, Mol. Cell. Proteomics, FASEB J., Mol. Cancer, Cell Reports, Aging-US, J. Proteomics Res., J. Med. Chem., Skeletal Muscle, Cancer Science, Oncotarget, Free Radic. Biol. Med., J. Biol. Chem., Mol. Microbiol., ACS Applied Materials & Interfaces, Frontiers in Pharmacology 等SCI国际刊物上发表研究论文159篇, 1篇论文入选Natural China 研究亮点论文(2008),1篇论文被美国生物化学与分子生物学联合会作为亮点工作重点报道(2009), 1篇论文入选Molecular Biosystems封面论文和研究亮点论文(2015)。这些SCI论文已被引用3000多次, 包括被Nature Reviews Cancer 等国际著名的学术期刊引用。此外,他还在国内核心期刊上发表了几十篇研究论文。他曾荣获2006度中国“王天眷”波谱学奖和其它奖项。正主持或主持过8项国家自然科学基金项目(其中重点基金项目1项)、1项中科院“引进高层次创新计划(A类)”研究基金项目,1项福建省“闽江学者”研究基金项目、1项福建省“引进高层次创新计划(A类)”研究基金项目以及1项“上海市优秀学科带头人计划(A类)”项目,作为第2课题组长参与科技部国家重点研发计划 “蛋白质机器与生命过程调控”的科研项目“病原菌核糖体调节因子的发现、鉴定及调节机制研究”。任克老师:从事影像诊断及介入治疗研究。作为参加者获国家科技进步二等奖1项,作为负责人获省级教学成果三等奖1项、省级医学科技成果二等奖1项。在研国家自然科学基金面上项目1项,参研国家重点研发计划项目2项,参加国家自然科学基金重点项目1项,完成多项国家及省市级课题。编写著作教材10余部,发表SCI论文11篇、中文核心杂志论文近百篇。林建忠老师:工作30年,拥有10多年linux系统下AFNI, SPM, FSL, freesurfer的脑功能及结构处理经验和多年python,keras,tensorflow卷积神经网络处理经验,发表SCI文章二十多篇。主持和参与多项重要项目,包括新型磁共振成像序列设计与重建算法研究、脑结构和功能适应性研究等。曾多次获得科技进步奖等荣誉。倪祖荣老师:电子学院电子科学系助理教授,从事磁共振及生物医学相关的软硬件开发,已发表多篇论文,并获得多项专利。

招生要求

欢迎有严谨科研态度、致力于成为行业精英,具备数学、医学、生物医工、电子信息、计算机、软件类背景考生报考。

博士要求:已在SCI期刊/EI期刊/行业顶级会议发表论文1篇或有明显创新的其他工作。

硕士要求:具备推免资格、通过全国统一招考且有省一等奖以上获奖(或在理论、编程、实验等方面有特长)。

注:团队硕士研究生招生上限4人

团队联络人:屈小波 quxiaobo@xmu.edu.cn